已知道因纽特人在该省定居了超过4000年，是典型的原住民。他们严格上属爱斯基摩人的一支，靠猎捕鱼类和极地动物为业，并建造雪屋为家。而最早欧洲人正式抵达此地的记载，是1576年英国探险家马丁·弗罗比舍率队在此一带探险，并首度接触因纽特人。

在欧洲人在加拿大殖民时，该省属西北地方的一部分，由哈德逊湾公司拥有。到1870年加拿大联邦成立，该公司把西北地方转让给加拿大政府。整个西北地方在随后时间不断分裂出其他省分，范围日渐缩小。到二次大战时代，西北地区辖地，包括了今日西北地区领域以及努纳武特。

由于位处极地，人口稀少，又是加拿大唯一远离公路系统的地区，该省一直以来的发展都较其他省分迟缓。在二次大战后，该地的因纽特人不断向加拿大政府抗争，欲获得自治权利。于1993年，加拿大国会签署《努纳武特法案》与《努纳武特领土声明协议法案》，拍板建立自治区。到1999年，再由西北地方分拆出努纳武特。